2011年，国际关係学院侦察与特种作战指挥专业和原军事体育综合训练基地合併组建特种作战学院。国际关係学院侦察与特种作战指挥专业1978年开办，培养了十五大代表冯敏，十六大代表赵正涛，十七大代表黄和平，十八大代表刘珪，“特战英雄”扈华国等一大批英雄模範人物。

2017年，成立陆军特种作战学院，以特种作战学院、桂林综合训练基地（原桂林陆军学院）为基础组建，副军级，主校区在桂林，占地12000余亩。

桂林主校区（原桂林陆军学院校区），1949年6月18日，桂林陆军学院前身是刘伯承、邓小平领导的第二野战军军政大学三分校创建于浙江金华。1955年为北碚步兵学校．1958年由重庆迁至桂林，改称桂林步兵学校。徐向前元帅为学院题写了"团结、创新、求实、献身"的校训，在半个多世纪的历程中，先后四迁校址，十四易校名，1986年9月定名为桂林陆军学院。1990年11月19日，江泽民同志到该院视察，题写了校名。2004年实行改革为广州军区综合训练基地。建院半个多世纪以来，学院先后为部队培养和输送了6万多名军事指挥人才，97%以上的毕业学员胜任第一任职，65%以上的立功受奖，不少毕业学员已经走上了师、军和大军区领导岗位，为军队现代化建设做出了重大贡献。根据习近平主席的军队改革要求，2017年，成立主校区在广西桂林的陆军特种作战学院，以特种作战学院、桂林综合训练基地（原桂林陆军学院）为基础组建，副军级，占地12000余亩。

广州校区（原广州特种作战学院校区），特种作战学院位于广州市中心城区，源于1953年成立的解放军体育学校，在60多年的建设历程中，在军事体育、特种训练、通信指挥等方面积澱了深厚的办学底蕴，作为一所新型作战力量人才培养院校，学科专业特色鲜明，形成了体系完善的人才培养模式，为军队培养了一大批体育、通信专业人才和高素质新型作战指挥人才。

解放军国际关係学院侦察与特种作战指挥专业1978年开办。2011年，国际关係学院侦察与特种作战指挥专业和原军事体育综合训练基地（原解放军体育学院）合併组建特种作战学院。

陆军特种作战学院主要承担陆军特种作战指挥军官、全军狙击手培训，以及海军陆战队、空降兵部分指挥生长军官本科基础教育任务。设作战指挥（特种作战分队指挥、侦察分队指挥、陆战分队指挥、空降分队指挥）、侦察情报（侦察分队指挥）、指挥信息系统工程（特种作战分队指挥、侦察分队指挥）等3个专业。

陆军特种作战学院积极投身建设强大的现代化新型陆军的宏伟事业中，牢记使命，振奋精神，实干创业，努力把学院建成特色鲜明、全军闻名、世界知名的特种作战人才培养基地、理论研究基地、科技创新基地、装备训练基地、特种兵文化传播基地、特种作战人才走向未来战场的前沿基地。

中国人民解放军陆军特种作战学院院长肖秋良、政委谢贻平。

陆军特种作战学院领导班子成员孙晓勇、王炳军、赵亮江、肖云开。

公开信息显示，肖秋良曾任原总参二部综合局副局长等职。

谢贻平早年曾在原南京军区服役，后调任解放军信息工程大学政治部主任，2015年改任该校副政委。

2018年9月17日，经过两天的激烈角逐，陆军“精武-2018”军事比武竞赛院校学员组竞赛成绩揭晓。陆军特种作战学院夺得象徵比赛最高荣誉的“精武之剑”。