全省共有16个港口，包括安庆港、芜湖港、马鞍山港、合肥港、蚌埠港5个主要港口，池州港、铜陵港、滁州港、淮南港、六安港、阜阳港、亳州港7个重要港口以及宿州港、淮北港、宣城港、黄山港等4个一般港口。2016年，初步统计全省拥有生产用码头泊位数1148个，泊位码头长度82437米，其中10000吨级及以上泊位数17个。

《规划》提出，围绕国家实施“长江经济带”“一路一带”等重大发展战略，构建统一的沿江港口营运管理平台，深化与上海港、宁波港、南京港战略合作。引导大型公用码头和液货、LNG等专业码头髮展，抓住引江济淮工程的重大发展机遇，加快合肥港公用码头建设以及长江、巢湖、新安江等重要旅游景区、库区旅游码头建设。