BSA(集团分离分析法)

生活百科 2023-01-25 18:02生活百科www.aizhengw.cn

BSA(集团分离分析法)

生物信息学中用于QTL或基因定位的一类分析方法

BSA(分离体分组混合分析法或混合分组分析法,又称 集团分离分析法。BSA法克服了很多作物难以得到近等基因系的限制,并且比近等基因系法省时省力,是一种非常实用的基因标记定位的方法,套用非常广泛。

基本介绍

  • 中文名集团分离分析法
  • 外文名Bulked Segregant Analysis
生物信息学中用于QTL或基因定位的一类分析方法
BSA(分离体分组混合分析法或混合分组分析法,又称 集团分离分析法,Bulked Segregant Analysis)分析法由Michlmore等…提出并成功地在莴苣中筛选出与目的基因相连锁的标记。该方法从一对具有目标基因的表型差异的亲本所产生的任何一种分离群体中,根据目标基因的表型分别选取一定数量的植株,构成 2个亚群或集团。将每群的 DNA等量混合,形成两个相对性状 的“基因池”(gene pool),然后用合适的分子标记对两个基因池进行分析,在两群间表现多态性的分子标记遗传上与目标性状基因座位相连锁。在获得了与目标基因相连锁的分子标记以后,可以利用某一作图群体进行分析以便进一步检测所得分子标记与目标性状基因的连锁程度,以及其在某已知分子图谱中或染色体上的位置,这样才能完成真正意义上的对基因的标记定位。由于建池时使用了特定的分离群体,并且在分组时仅对目标性状进行选择,这样可以保证其他性状的遗传背景基本相同,两个基因池之间理论上就应主要在目标基因区段存在差异,两基因池又被称为近等基因池,这就排除了环境及人为因素的影响,使研究结果更为準确可靠¨。BSA法克服了很多作物难以得到近等基因系的限制,并且比近等基因系法省时省力,是一种非常实用的基因标记定位的方法,套用非常广泛。
可与BSA相结合用于基因定位的分子标记有多种,常用的分子标记有 RFLP(限制性片段长度多态性,Restriction Fragment Length Polymorphism),RAPD(随机扩增多态性 DNA,Random Amplified Polymorphism DNA),AFLP (扩增片段长度多态性,Amplified Fragment Length Polymorphism),SSR(简单重複序列,Simple Sequence Repeats)SSR等。
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