最初，CGI是在1993年由美国国家超级电脑套用中心（NCSA）为NCSA HTTPdWeb伺服器开发的。这个Web伺服器使用了UNIXshell环境变数来保存从Web伺服器传递出去的参数，然后生成一个运行CGI的独立的进程。

程式语言Perl是一个广泛被用来编写CGI程式的语言，但CGI的一个目的是要独立于任何语言的。Web伺服器无须在这个问题上对语言有任何了解。事实上，CGI程式可以用任何脚本语言或者是完全独立程式语言实现，只要这个语言可以在这个系统上运行。除Perl外，像Unix shellscript,Python,Ruby,PHP,Tcl,C/C++,和Visual Basic都可以用来编写CGI程式。

实现维基百科编辑的CGI程式的一个例子用户代理程式向这个CGI程式请求某个名称的条目，如果该条目页面存在，CGI程式就会去获取那个条目页面的原始数据，然后把它转换成HTML并把结果输出给浏览器；如果该条目页面不存在，CGI程式则会提示用户新建一个页面。所有维基操作都是通过这个CGI程式来处理的。

CGI的工作方式，从Web伺服器的角度看，是在特定的位置（比如http://www.example.com/wiki.cgi）定义了可以运行CGI程式。当收到一个匹配URL的请求，相应的程式就会被调用，并将客户端传送的数据作为输入。程式的输出会由Web伺服器收集，并加上合适的档头，再传送回客户端。

一般每次的CGI请求都需要新生成一个程式的副本来运行，这样大的工作量会很快将伺服器压垮，一些更有效的技术像mod_perl，可以让脚本解释器直接作为模组集成在Web伺服器（例如Apache）中，这样就能避免重複载入和初始化解释器。不过这只是就那些需要解释器的高级语言（即解释语言）而言的，使用诸如C一类的编译语言则可以避免这种额外负荷。由于C及其他编译语言的程式与解释语言程式相比，前者的运行速度更快、对作业系统的负荷更小，使用编译语言程式是可能达到更高执行效率的，因为开发效率等原因，在目前直译性语言还是最合适的。

如果代码只是偶尔改变的话，我们可以在伺服器产生一个新的进程在编译代码之前进行处理。有一个例子是FastCGI，还包括其它编写的加速器，它会在第一次调用脚本时，在系统的某个地方保存脚本编译过的版本。这样对这个档案以后的请求就会自动转向这个编译过的代码，而不用每次调用脚本解释器来解释脚本。当更改了脚本，加速器的临时快取会被清空来保证调用的是新的版本的脚本。

另一个方法是直接把解释器放在Web伺服器中，这样就无须新建一个进程来执行脚本。Apache伺服器有很多这样的模组，像mod_cplusplus、mod_perl、mod_php、mod_python、mod_ruby、和mod_mono。