CRJ900飞机于1999年10月对外公布研製方案，2000年第二季度确定了合作伙伴和零部件供应商。CRJ900是CRJ700的加长型，与CRJ100/200/700一起构成CRJ系列，覆盖50～90座级的支线客运航线。CRJ系列在大飞机难以盈利的航线上具有极其独特的优越性，它不仅可以用于扩大点对点的支线运输，还可以用于增加从枢纽机场的辐射式运输，还能使航空公司改善乘客服务并提高效益。

CRJ900原型机是由CRJ700的原型机C-FRJX改装而成，加长了机身，保留了CRJ700的机翼、发动机和起落架，2001年2月21日进行了首飞。首架生产型飞机于2001年第一季度开始组装，2001年10月20日完成首飞。2002年9月9日获得加拿大运输部适航证，同年10月25日获得美国联邦航空局适航证，12月23日获得欧洲航空安全局适航证。首架飞机于2003年2月3日交付美国梅萨航空公司，并于同年4月26日投入使用。

CRJ900项目的研製成本为2亿加元，单机价格为3000万加元(按2002年币值计算)。庞巴迪宇航集团预计未来20年CRJ900系列飞机市场约为800架。截至2008年7月31日，CRJ900飞机共获订单250架，交付172架。

CRJ900飞机主要型别有CRJ900基本型以及在基本型基础上发展的CRJ900ER延程型和CRJ900LR远程型，目前最新的型号为CRJ900NG型。