大雁镇教育管理中心前身是位于大雁矿区的原大雁矿务局教育处；1999年大雁矿务局转制为大雁煤业有限责任公司，设大雁煤业公司教育处。随着企业改革的深入，逐步剥离了企业办社会职能，大雁煤业公司教育处被移交给鄂温克族自治旗政府并转制为大雁教育分局；至2004年末，原隶属于大雁煤业公司的1所高中、7所国中和6所国小（另有1所国小在移交前解体）全部移交给鄂温克族自治旗政府，大雁煤业公司教育处完成转制。2006年大雁矿区和巴彦嵯岗苏木合併为鄂温克族自治旗巴雁镇，大雁教育分局改为巴雁镇教育分局；后又取消分局，不再设定局级单位，设定巴雁镇教育管理中心。2011年5月，巴雁镇分治，设大雁镇和巴彦嵯岗苏木，巴雁镇教育管理中心变为大雁镇教育管理中心。