为TOMY的ZOIDS复活计画打头阵的作品。最初连载于月刊《龙漫CORO-CORO》1999年的5月号至2001年的10月号，后由国小馆发行单行本。与动画版相比除了基本人物相同以外剧情几乎完全不同。在动画《ZOIDS新世纪/ZERO》放映期间又加入了长牙狮零式和狂暴战龙（Berserk Führer）。现在其续篇《机兽新世纪ZOIDS EX》（上山道郎个人爱好所创作，非官方承认作品）在作者的个人网站上不定期连载中。

漫画中小邦最先搭乘的Zoid是机动奔狼而不是重装长牙狮，原因是当时在製作相关集数时，上山道郎还没有拿到用于作画参考的重装长牙狮的模型玩具。