黄宇，男，2003年毕业于复旦大学生物科学专业，2010年获美国南加州大学生物信息博士学位。现任中国科学院上海药物研究所研究员，课题组长。
基本介绍
- 中文名黄宇
- 外文名Yu Huang
- 国籍中国
- 民族汉
- 职业中国科学院上海药物研究所研究员
- 毕业院校复旦大学，University of Southern California
- 主要成就中科院百人计画
现任中国科学院上海药物研究所研究员、课题组长，2015年入选中国科学院百人计画, 曾任美国Illumina Inc公司生物信息科学家。加利福尼亚大学洛杉矶分校人类遗传系博士后，南加州大学生物信息学博士，复旦大学生物本科。开发了Illumina公司的DNA甲基化云计算软体 MethylSeq，并套用到诊断癌症和发现癌症标誌物；研製出第一个非人灵长类群体基因资源和发现一系列大型家谱表型相关的基因。在Nature、Bioinformatics、BMC Biology等杂誌上发表SCI论文15余篇。主要从事个性化药物相关的生物信息模型和算法研究，癌症CNV突变发现算法Accurity，发现个性化药物敏感标誌物，根据基因变异预测药物疗效等。
教育经历
2003.8 - 2010.10 美国南加州大学，生物信息，博士
1999.9 - 2003.7 复旦大学，生物科学，学士
工作经历
2015.05 - 至今 上海药物研究所，研究员，研究组长
2014.04 - 2015.05 Illumina Inc. 圣地亚哥，生物信息科学家
2010.11 - 2014.04 加利福尼亚大学洛杉矶分校，博士后
研究方向
1. 生物信息方法和模型肿瘤进化模型、肿瘤标誌物发现方法、疾病risk预测、细分最佳化人群方法
2. 个性化药物研究: 靶标发现、研究药物作用机理，药物耐药机制
奖励及荣誉
- 2015年中科院百人计画
代表论着
- Z Luo, X Fan, Y Su, YS Huang# (2018) Accurity: accurate tumor purity and ploidy inference from tumor-normal WGS data by jointly modelling somatic copy number alterations and heterozygous germline single-nucleotide-variants. Bioinformatics
- YS Huang, V Ramensky, et al., Nelson Freimer (2015) Sequencing strategies and characterization of 721 vervet monkey genomes for future genetic analyses of medically relevant traits BMC Biology
- MW Horton, AM Hancock,YS Huang, C Toomajian, S Atwell, A Auton, NW Muliyati, A Platt, FG Sperone, BJ Vilhjálmsson, M Nordborg, JO Borevitz, J Bergelson (2012): Genome-wide patterns of genetic variation in worldwide Arabidopsis thaliana accessions from the RegMap panel. Nature Genetics
- YS Huang#, M Horton, BJ Vilhjálmsson, Seren, D Meng, C Meyer, MA Amer, JO Borevitz, J Bergelson, M Nordborg (2011): Analysis and visualization of Arabidopsis thaliana GWAS using web 2.0 technologies. Database 2011; (#: corresponding author)
- S Atwell,YS Huang, BJ Vilhjálmsson, G Willems, M Horton, Y Li, D Meng, A Platt, A Tarone, TT. Hu, R Jiang, NW Muliyati, X Zhang, MAi Amer, I Baxter, B Brachi, J Chory, C Dean, M Debieu, J de Meaux, JR Ecker, N Faure, JM Kniskern, JD Jones, T Michael, A Nemri, F Roux, DE Salt, C Tang, M Todesco, MB Traw, D Weigel, P Marjoram, JO Borevitz, J Bergelson, M Nordborg (2010): Genome-wide association study of 107 phenotypes in a common set of Arabidopsis thaliana inbred lines. Nature (: equal contribution.)
- A Platt, M Horton,YS Huang, Y Li, A Anastasio, NW Mulyati, J gren, O Bossdorf, D Byers, K Donohue, M Dunning, E Holub, A Hudson, V Le Corre, O Loudet, F Roux, N Warthmann, D Weigel, L Rivero, R Scholl, M Nordborg, J Bergelson, JO. Borevitz (2010): The Scale of Population Structure in Arabidopsis thaliana. Plos Genetics (: equal contribution.)
- Y Huang, H Li, H Hu, X Yan, MS. Waterman, H Huang and XJ Zhou (2007): Systematic discovery of functional modules and context-specific functional annotation of human genome. Bioinformatics (ISMB 2007) 23:i222-229. (: equal contribution.)