全基因组测序发现依维莫司敏感性的遗传学基础
新治疗药物开发方面的不足也许对死亡率下降缓慢负有部分责任。另外,该病是所有癌症中复发率最高的,大多数患者(大约50%到70%)都有疾病进展或复发的经历。
David Solit、Gopa lyer和合作者们对评估mTOR抑制剂依维莫司作为单用药物,以治疗进展型、转移性膀胱癌的作用的这项二期临床试验的结果发生了兴趣。在该试验中,有一名患者在治疗开始后的1年内,对该药治疗完全应答。他们提出假说,认为该患者肿瘤存在特殊的遗传缺陷导致了其对治疗的高应答。
为了验证该假说,研究者们利用全基因组测序方法对该患者肿瘤组织及外周血DNA进行了测序。他们共检测到了17136个体细胞突变,在其中他们发现在TSC1(结节性硬化症复合体1)基因上存在两个碱基对的缺失,在前期研究中已经发现该基因在膀胱癌中会发生突变,该基因的缺失突变也被认为会导致mTOR通路的激活。对膀胱癌细胞系TSC1基因的抑制,导致了对mTOR抑制剂的敏感性上升。
研究者们试图对更多在此次2期临床试验中用依维莫司治疗的患者的肿瘤进行分析。靶向测序显示,在进行分析的另外109个肿瘤中,8%发生了TSC1突变,且TSC1突变与依维莫司敏感性之间存在相关性。有4名对依维莫司治疗应答很低的患者发生了TSCI突变,而在9名肿瘤有进展的患者中,8名患者的TSC1为野生型。TSC1突变的患者在复发时间上存在着显著的延迟(4.1月vs. 1.8月)。
该研究的发现发表在了Science杂志上。该结果强调了鉴定肿瘤的分子特征的重要性,并证明全基因组测序在临床机构中用于鉴定之前尚未探清的药物敏感性生物标志物中的适用性,这些标志物可能有助于找出那些更有可能对目标抗癌药物产生应答的患者。